WA488_24062_P939_T52-z3-PB.pdf

(9814 KB) Pobierz
POSTĘPY;
BIOCHEMII
,*
POLSKIE
TOWARZYSTWO
BIOCHEMICZNE
WARSZAWA 2006
TOM 52
V NUMER 3
Struktura DNA od A do Z
Bakteryjne topoizomerazy typu II
Transportery ABC
/
.0 [
i '
'
http://rcin.org.pl
. nrsaSK .'
MP Biomedicals Family
Biomedicals
i
laboratories
©
Row
I
mmun
O
t
Miles
Research
Products
Nutritional
Biochemicals
r p w j Enzyme
^ ^ S y s te m s
Products
Capper
Q 'BIQgene
DNA-ERASE™
Roztwór do usuwania D N A z powierzchni roboczych oraz narzędzi
laboratoryjnych.
Wygodny i łatwy w użyciu, nie jest żrący oraz nie zawiera związków
kancerogennych.
DNA-erase™ jest stabilny i odporny na wysokie temperatury.
Dostępny w form ie gotowej do użycia.
RNase-ERASE™
Roztwór do usuwania RNaz z powierzchni roboczych oraz narzędzi
laboratoryjnych.
Wygodny
l
łatwy w użyciu spray usuwa wszelkie zanieczyszczenia
ze stołów, szkła i plastiku. Nietoksyczny, dostarczany w form ie gotowej
do użycia.
Nr kat.
821805
821682
821683
821684
Nazwa
DNA-ERASE™
RNase ERASE™
RNase ERASE™
RNase ERASE™
Ilość
500 ml
250 ml
1)21805
L O T N O . 1362J
53
,
2 x 1 2 5 ml
250 ml
1 : 1 * 3 5 4 0530 EU 33(0)38367504(1 m
*
DNA-Erase™
Oferta MP BIOMEDICALS obejmuje:
biochemikalia, przeciwciała,
odczynniki do biologii molekularnej,
elektroforezy, apoptozy.
N ow a, ulepszona strona MP B IO M EDICALS!
http://www.m pbio.com
http://rcin.org.pl
DYSTRYBUTOR: abo Grażyna Boreysza
ul. Podleśna 6 a , 8 0 - 2 5 5 Gdańsk
Biuro: ul. M ałachowskiego 1, 8 0 - 2 6 2 Gdańsk
tel.: (58) 341 21 4 3 ; fax: (58) 5 2 0 3 3 8 0
e-m ail: ab o @ a b o .co m .p l; w w w.abo.com .pl
S
P
I
S
T
R
E
Ś
C
I
Postępy Biochemii — vol. 52, nr 3, 2006
WYDARZENI A/OPINIE/KOMENT ARZE
O pinia i komentarze do projektu ustawy z 29 maja
^)faa*Ćvo o
223
224
ARTYKUŁY PRZEGLĄDOWE
Struktura DNA od A do Z — biologiczne implikacje różnorodności
strukturalnej DNA
i
M ałgo rzata B ukow iecka-M atusiak, L ucyna A. W o źn iak
N aprawa chemicznie metylowanego DNA w
Escherichia coli —
rola
229
239
C elina Jan io n
Redagowanie retrowirusowego DNA jako przkład m echanizm u obronnego
247
M a łg o rz a ta P up eck a, A n d rzej P acak
253
W NASTĘPNYM NUMERZE:
ARTYKUŁY PRZEGLĄDOWE
W ęd rów k i receptorów
jon otrop ow ych — do syn a p sy
i z pow rotem
D o ro ta N o w ick a
P ierw sza dekada ery gen om iczn ej
A d ria n n a S koneczna
Ś cieżk i sygn alizacyjn e cz y n n ik ó w
w zrostu TGF-(3
M a łg o rz a ta Z im o w sk a
M olekularne m eto d y d ia g n osty k i
i oceny efe k ty w n o śc i terapii w e
w sp ó łczesn ej h em a to o n k o lo g ii
M a łg o rz a ta D a w id o w sk a ,
Jacek W ach o w iak , M ichał W itt
Z b ig n ie w W arkocki, M a re k Figlerow icz
Aptamery w diagnostyce klinicznej
A d a m Szpechciński, A lin a G rz a n k a
Badania struktury i funkcji prokariotycznych topoizomeraz klasy II szansą
dla poszukiw ania i syntezy nowych leków przeciwbakteryjnych
271
M ichał P ietrusińsk i, P a w e ł Stączek
Kinaza białkowa aktywowana przez AMP — kluczowe znaczenie w
regulacji m etabolizm u
R o b ert Jarzy n a
O dpow iedź na stres komórkowy i ekspresja genów
Hsp70
w męskich
komórkach rozrodczych
W iesław a W idłak
Roślinne transportery ABC — rodzina z tradycjami
M ichał Jasiński, M arek Figlerowicz
303
Sabina Janicka, H alina A u gustyniak
313
M ariola K atarzyna Piestrzeniewicz, Jakub Fichna, A n n a Janecka
320
Irena Baranowska-Bosiacka, D ariusz C hlubek
330
Sabina K ęd zierska
Rysunek na okładce:
Front cover im age „Bottled gene „ by Paul
A. Thiessen, w w w .chem icalgraphics.com ,
w ith perm ission.
260
283
289
296
P ostępy Biochemii 52 (3) 2006
http://rcin.org.pl
I
ADVANCES IN BIOCHEMISTRY VOL. 52, NO. 3, 2006
Events/O pinions/Com m ents
223
REVIEWS
D N A structure from A to Z — biological implications of structural diversity of D N A
Chem ically m ethylated D N A repair in
Escherichia coli
— the role of AlkB protein
The innate antiretroviral defense of human cells, based on the D N A editing
Trans-acting short interfering RNAs
Aptamers in clinical diagnostics
Bacterial type II topoisom erases as targets for antibacterial drugs
AMP-activated protein kinase — the key role in metabolic regulation
The heat shock response and HSP70 gene expression in male germ cells
Plant ABC transporters — the fam ily w ith tradition
M ultifunctional 14-3-3 proteins of plant cell
O pioid receptors and their selective ligands
Biochem ical m echanism s of neurotoxic lead activity
Structure, function and m echanisms of action of ATPases from the A A A superfam ily of proteins
229
239
247
253
260
271
283
289
296
303
313
320
330
KILKA SŁÓW OD REDAKTORA DO AUTORÓW
Szanow ni Państwo,
Korzystając z przywileju redaktora naczelnego chciałbym podzielić się z Państwem dwoma refleksjami. Pierwsza bardzo optymistyczna, że
nasze czasopismo nadal ukazuje się drukiem. To jest między innymi zasługą Autorów zaakceptowanych do druku artykułów, którzy w prze­
ważającej liczbie zgadzają się ponosić część kosztów druku artykułów (na 36 artykułów opublikowanych w numerach 1-3 w 2006 roku Autorzy
26 z nich opłacili "page charges"). Z tym problemem wiążą się Państwa częste prośby bym przesłał określony artykuł w wersji elektronicznej.
Jakkolwiek tak pow inno być w przyszłości, w obecnej chwili nie m ożem y rozpowszechniać zawartości czasopisma w tej formie, do momentu
aż udostępnim y je całkowicie "on-line". Nie nastąpi to jednak szybko. Wyjątek czynimy w stosunku do Autorów pracujących zagranicą, dla
których jest to jedyna m ożliwość otrzymania większej liczby kopii swojego artykułu.
Druga refleksja wiąże się, ze stosowaniem norm językowych, które redakcja stara się konsekwentnie wprowadzać na łamy „Postępów Bio­
chemii". Dlatego poniżej w ym ieniam niektóre z najczęściej spotykanych odstępstw od norm przyjętych przez redakcję, a w przyszłości poku­
sim y się o skatalogowanie tych odstępstw i podanie obok określeń, które są akceptowane przez redakcję. Przykładowo w artykułach pojawiają
się często różne warianty „aminokwasów, motywów, domen, białek konserwowanych ewolucyjnie". Redakcja prosi Autorów o stosowanie
wyrażenia „sekwencje reszt aminokwasowych, domena, białko o strukturze zachowanej w ewolucji". Równie często używane są nieprawid­
łow e terminy takie jak: inhibicja (zamiast hamowanie), membrana (zamiast błona), ubikwitynacja (zamiast ubikwitylacja), transdukcja synału
(zamiast przekazywanie sygnału), ścieżki sygnalne (zamiast szlaki sygnałowe), cytozol (zamiast cytosol), aminokwas ewolucyjnie konserwa­
tyw ny (zamiat reszta aminokwasowa zachowana w ewolucji), alternatywny splicing (zamiast różnicowe cięcie i składanie mRNA), nabłonkowy
czynnik wzrostu (zamiast naskórkowy czynnik wzrostu), ludzkie komórki (zamiast komórki człowieka), drożdżowe białko (zamiast białko z
drożdży lub białko drożdży), domena N-terminalna (zamiast domena N-końcowa). Jak widać szereg nieprawidłowości wynika z bezpośredniego
tłumaczenia angielskich wyrażeń na język polski. Redakcja apeluje do przyszłych Autorów o zwrócenie uwagi na poprawność polskiego języka
naukow ego, mając na w zględzie rolę „Postępów Biochemii" w procesie kształtowania w iedzy biochemicznej w naszym społeczeństwie.
D ziękuję za uwagę i zapraszam jak zwykle do lektury naszego czasopisma oraz do częstego odwiedzania naszej strony internetowej pod
adresem ww w.postepybiochem ii.pl.
Sławomir Pikuła
P A R T N E R P O S T Ę P Ó W B IO C H E M II
O LY M PU S
Your V is io n , O u r Future
Redaktor naczelny:
Sławomir Pikuła; e-mail: s.pikuIa@nencki.gov.pl, tel. (022) 5892347,
Redaktor senior:
Zofia Zielińska
Redaktor działu krajowego:
Teresa Wesołowska; e-mail: redbioch@sci.pam.szczecin.pl,
Redaktor działu „Forum Młodych Biochemików":
Grzegorz Bartosz; e-mail: gbartosz@biol.uni.lodz.pl
Redaktorzy:
Joanna Bandorowicz-Pikuła, Jolanta Barańska, Andrzej Dżugaj, Krystyna Grzelak, Lilia Hryniewiecka, Danuta Hulanicka, Andrzej Jerzmanowski, Andrzej Kasprzak, Wanda Kłopocka,
Liliana Konarska, Paweł Pomorski, Aleksander F. Sikorski, Anna Szakiel, Adam Szewczyk, Tomasz Twardowski, Marek Zembala, Krzysztof Zabłocki, Alicja Żylicz
Sekretarz redakcja:
Hanna Laskowska; e-mail: h.laskowska@nencki.gov.pl
Skład i łamanie:
M ałgorzata Basaj; e-mail: biochem@nencki.gov.pl
Adres redakcji:
"Postępy Biochemii", ul. Pasteura 3,02-093 Warszawa; e-mail: postepy@nencki.gov.pl; h ttp :// www.postepybiochemii.pl
Wydawca:
Polskie Towarzystwo Biochemiczne; ul. Pasteura 3, 02-093 Warszawa, tel/fax (022) 6582099, e-mail: ptbioch@nencki.gov.pl, h ttp://w w w .ptbioch.edu.pl
Kwartalnik "Postępy Biochemii" jest wydaw any z pomocą finansową Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego, "Postępy Biochemii" są indeksowane w Medline i Agrolibrex. Nakład 850 egz.
Redakcja nie zwraca materiałów niezamówionych, a w publikowanych artykułach zastrzega sobie praw o do dokonywania niezbędnych skrótów i zmian.
Redakcja nie odpow iada za treść zamieszczanych w czasopiśmie ogłoszeń.
II
http://rcin.org.pl
w w w .postepybiochem ii.pl
WYDARZENIA
-
OPINIE
-
KOMENTARZE
Opinia i komentarze do projektu ustawy z 29 maja 2006 r.
„Prawo o organizmach genetycznie zmodyfikowanych"
T om asz T w a r d o w sk i
Polska Federacja B iotechnologii, Instytut
Biochemii T echnicznej, P olitechnika Ł ódz­
ka, ul. S tefanow skiego 4 /1 0 , 90-924 Ł ódź
e-mail: tw ardow s@ ibch.poznan.pl
G ospodarka i jej rozwój m uszą
opierać się na solidnych podstaw ach:
1) naukow ych, 2) p ra w n y c h i 3) spo­
łecznych. Fakty n au k o w e są repro-
d u ktyw n e i nie m ogą być ustalane
poprzez głosow anie. N orm y praw ne
w inny opierać się na dany ch obiek­
tyw nych, jednakże są efektem kom ­
prom isów , często wynikających z
przesłanek politycznych. O pinie spo­
łeczne [a w konsekw encji głosy w y ­
borców] są w istotnym sto p niu efek­
tem emocji i ró ż n o rod n y ch działań,
często [w ew nętrznie] sprzecznych.
W p rzed staw io n y m projekcie usta­
w y z 29 maja 2006 r.
„Prawo o orga­
nizmach genetycznie zm odyfikow a­
nych"
jednoznaczny jest negatyw ny
stosunek u staw o d aw cy do now oczes­
nej biotechnologii. P od staw o w e kon­
kluzje tego d o k u m e n tu zostały b ar­
dzo jasno i klarow nie sform ułow ane i
m ożna je streścić następująco:
1. Z am knięte użycie G M O jest ak­
ceptow ane, jednakże zw iązane jest z
w ielom a restrykcjami.
2. Uw olnienie dośw iadczalne GM O
do środow iska jest niedopuszczalne.
3. P rodukty GM inne niż żyw ność
nie będą d ostępne na polskim rynku.
4. GM żyw ność m oże być tylko
sp row ad zan a [im portow ana i w łaś­
ciwie oznakow ana], ale nie p ro d u k o ­
w ana czy p rzetw arzan a w naszym
kraju.
5. GM pasze nie są akceptow ane.
6. U praw a GM roślin nie jest do ­
puszczalna.
Należy jednoznacznie stw ierdzić,
że dokum ent ten m a b ardzo duże
znaczenie dla rozw oju biotechnologii,
a przez to całej polskiej
bioekonom ii.
Przede w szystkim w kontekście roz­
woju przem ysłu biotechnologiczne­
Postępy Biochemii 52 (3) 2006
go oraz potencjalnego inw estow ania
środków przez zew nętrznych inw e­
storów. Term in
bioekonom ia
o zna­
cza oparcie rozwoju gospodarki na
surow cach odnaw ialnych i w ykorzy­
staniu m etod biologicznych. Polska
dysponuje całym kom pleksow ym
zapleczem dla rozw oju bioekonomii.
N orm y praw ne m ogą ten rozwój sty­
m ulow ać lub zaham ować.
A spekty oceny projektu m uszą
uw zględniać następujące elementy:
— form alne [prawne],
— ekonomiczne:
finanse państw a,
rozwój gospodarki,
rynek pracy,
— efekty braku tej norm y prawnej.
W ocenie m usim y zauw ażyć za­
rów no POZYTYWNE, jak i NEGA­
TYWNE efekty proponow anej nowej
ustaw y. Jako POZYTYWNE należy
z pew nością zauważyć: aktualizację
n orm y praw nej i jednoznaczne sfor­
m ułow anie stanow iska Rządu. N ato­
m iast jako NEGATYWNE:
— brak zgodności z norm am i
p raw ny m i UE (dyrektywy) oraz kon­
w encjami m iędzynarodow ym i (np.
TRIPS, CBD i BP) i zasadam i członko­
stw a w organizacjach m iędzynarodo­
w ych (np. WTO),
— brak równości podm iotów —
p ro po n o w any projekt ustaw y zdecy­
dow anie dyskrym inuje potencjalnych
u ży tkow ników i producentów GMO,
— w strzym anie rozw oju w ażnych
d ziedzin gospodarki narodowej, jak
np. produkcja biom ateriałów czy też
bioenergetyki,
— straty gospodarki: aktualne,
zw iązane przykładow o z emigracją
kad ry biotechnologów oraz koniecz­
nością im p o rtu wielu p ro duktów u z y ­
skiw anych z zastosow aniem technik
inżynierii genetycznej (jak np. pasze,
horm ony, zestaw y diagnostyczne),
które z pow odzeniem m ogłyby być
p rodukow ane w kraju, z w y k o rzy sta­
niem rodzim ego potencjału k a d ro w e ­
go i gospodarczego; w przyszłości,
powstająca obecnie luka technologicz­
na będzie owocować w perspektyw ie
jednej generacji; emigracja k adry czy
też brak rozwijania w łasnych techno­
logii będą mieć fatalne skutki dla n a ­
szej gospodarki.
W kw ietniu 2006 r. przyjęto now eli­
zację „ustaw y o nasiennictw ie", która
zakazuje w Polsce h andlu m ateriałem
siew nym genetycznie zm odyfikow a­
nym. Takie uregulow ania p ra w n e są
sprzeczne z wieloma m ięd zy n aro d o ­
w ym i aktam i praw nym i, jak p rzyk ła­
dowo: dyrektyw y UE, konwencje np.
TRIPS i WTO, członkostw a w orga­
nizacjach m iędzynarodow ych, np. w
OECD.
W przedłożonym projekcie szereg
proponow anych rozw iązań i stw ier­
dzeń należy uznać za błędne lub p o ­
zbaw ione podstaw . W prow adzanie
takich założeń do ureg ulow ań p ra w ­
nych będzie skutkow ać istotnym i
stratami gospodarczym i.
PRZYKŁADOWO:
N iepraw dą jest, że now a n o rm a
praw n a spow oduje utw orzenie n o ­
w ych miejsc pracy. O dw rotnie: bio­
technolodzy, którzy nie m ogą re a ­
lizować swej pracy zaw odow ej w e
w łasnym kraju będą em igrow ać, a
w konsekwencji restrykcyjnej n o rm y
prawnej firmy nie będą inw estow ać w
przem ysł biotechnologiczny.
Podane „now e" miejsca p ra w n e
dotyczą administracji i nadzoru, a nie
rozwoju gospodarki narodow ej. Po­
dane dane dotyczące szacunku licz­
by analiz i ich kosztów, jak rów nież
liczby osób, które będą zaan g ażo w a­
ne przy kontroli, są zdecydow anie
zaniżone. Z całym naciskiem należy
podkreślić, że są to now e miejsca p ra ­
cy nieprodukcyjne, a adm inistracyjne
i kontrolne.
http://rcin.org.pl
223
Zgłoś jeśli naruszono regulamin