EGZAMIN: genomika
kilka pytan z zeszłego roku :31) po pierwsze była sekwencja i trzeba było znaleźć ramki odczytu, ile intronów (wiec trzeba znać kodon start, stop i miejsca wycinania intronów)
2) jaki program/macierz dla krótkich białek
3) bazy białkowe wszystkie programy
4)metody i typy substytucji
5)dot matrix, delecje, insercje ( to co robilismy w execlu rozpoznać czy zaszłą insercja, duplikacja itp)
6)zjawiska kształtujące wielkość genomów
7) dlaczego u eukariota trudniej znaleźć sekwencje kodujące
8)pojęcia: genomika, bioinformatyka,ORF,proteom, ortologi
9) narysować/rozpoznać drzewko z ego zapisu w nawiasach np ((A,B)C(D,E))
10) na podsawie drzewka jak wygląda przodek (sekwencja) i jakie zmiany zaszły
11)metoda parsynomi
12) W którym roku zakończenie projektu human genome project, w którym roku sekwencja pałeczki grypy
13)mtREV,
14)E value
15)Dlaczego sekwencje ewoluują w różnym tempie
16)Dlaczego u eukariota wielkość genomu nie odpowiada ilości genów
17)Policzyć odległośći (zegar molekularny)
18)które częstsze tranzycje/transwersje
19) Dlaczego obserwowane mutacje nie odpowiadają ich rzeczywistej liczbe
20) system scorów
21)mikromacierze
22)wielkość baz danych ( genbank ile sekwencji)- jest taki slaj genbank statysyka i to z tego wykresu
23) Jaki format zapisu (rozszerzenie) do jakiego programu
24) Nazwy programów nawet tych którch nie używaliśmy
Petroc