CASESTUDY13.pdf

(148 KB) Pobierz
Poznań 7 listopada 2008
CASE STUDY 3
Analiza danych medycznych nt. leczenia pacjentów cierpiących na
kamicę nerkową.
(Copyright Jerzy Stefanowski -, Instytut Informatyki PP
zastrzeżenia dotyczą opisu problemu i ograniczonej dostępności do danych)
Wprowadzenie
Załóżmy,
że
współpracujesz ze szpitalem lokalnego uniwersytetu w ramach zastosowań
metod informatycznych w medycynie; w szczególności analizy danych. Oddziały tegoż
szpitala prowadzą działalność nie tylko w zakresie leczenia pacjentów, szkolenia studentów
ale także badawczą. W działalności badawczej często poszukuje się odpowiedzi na temat
skuteczności nowych leków, wprowadzania nowych procedur diagnostycznych i
terapeutycznych. Ma to znaczenie zarówno badawcze jak i szkoleniowe, np. dla studentów
czy "młodszych" lekarzy stażystów.
W ostatnim czasie zwrócił się do Ciebie z prośbą o współpracę - konsultację ordynator
jednego z oddziałów. Celem była analiza doświadczenia klinicznego w zakresie leczenia
kamicy moczowej metodą kruszenia kamieni za pomocą techniki fali uderzeniowej
generowanej poza organizmem (ang. ESWL). Poszukiwano modeli charakteryzujących stan
pacjentów po zabiegu (bez komplikacji lub z komplikacjami) oraz wspomagających
długoterminowe prognozowanie wyniku leczenia. Opis problemu medycznego w języku
angielskim zawarty jest w dodatkowym pliku.
Dane zbierano na podstawie wypełniania ankiet związanych z wykonywanymi zabiegami. Dotyczą one 500
pacjentów opisanych za pomocą 33 atrybutów (nominalnych lub porządkowych). Dostępne są dwie możliwości
zdefiniowania klasyfikacji pacjentów. Klasy decyzyjne są względnie zrównoważone
Problem, jaki bada zespół lekarski, dotyczy poszukiwania istotnych zależności w danych i
regularności pomiędzy atrybutami, a także ustalania hierarchii ważności atrybutów
opisujących pacjentów. Zakładając,
że
jakość danych jest wystarczająca do oceny stanu
pacjentów po zabiegu lub przewidywania przebiegi leczenia (obie klasyfikacje) można dalej
postawić pytanie o możliwość zbudowania symbolicznej reprezentacji wiedzy klasyfikacyjnej
(pokazującej jawnie związek między wartościami najlepszych atrybutów o klasyfikacją
pacjentów).
Dotychczasowa opinia o tych danych wskazuje,
że
nie jest to „łatwy” zbiór danych, w którym
można się spodziewać jednoznacznych wniosków i odnalezienia wysoce skutecznych
klasyfikatorów.
W załącznikach otrzymujesz (w języku angielskim - z uwagi na przygotowywaną pracę o
charakterze raportu):
1. Opis problemu medycznego
2. Plik z danymi (format isf)
Powinieneś pamiętać, iż nie masz wpływu na rozmiar dostępnych danych, nie możesz
oczekiwać dostarczenia dodatkowych opisów pacjentów; zostało to wykonane przed Twoim
udziałem w studium badawczym; Tzn. nie będziesz miał dodatkowych obserwacji lub
wprowadzenia dodatkowych atrybutów.
Natomiast, jeśli potrafisz ocenić jakość otrzymanych danych możesz dokonywać
przeskalowań lub przedefiniowań atrybutów (np. tworzyć nowe w oparciu o pomierzone),
jeśli ich końcowa postać jest akceptowalna dla potencjalnego użytkownika (czytaj ma
potencjalnie dogodną interpretacje medyczną).
Inne uwagi metodyczne:
Opłaca się badać jakość dostarczonych danych (były one zbierane przez osoby, które nie
znają podstaw Twoich metod eksploracji danych);
•
•
•
•
Interesujące jest badanie wzajemnych współzależności tkwiących w danych;
Nie istnieje jasno wyrażony atrybut decyzyjny, co więcej może być ich wiele.
Warto stosować więcej niż jedną metodę eskploracji danych (ukierunkowanych na rózne
formy wiedzy i różne ich reprezentacje)
Uwaga z powodu silnego eksploatowania na zajęciach dotychczas technik budowy
klasyfikatorów, zwracam uwagę
że
automatyczna klasyfikacja pacjentów nie jest zawsze
akceptowana przez wielu lekarzy; może być używana jednak jako miara pewności czy
wiarygodności wyników;
Jeśli chcesz rozważać także budowę klasyfikatorów, Lekarze nie skupiają się na globalnej
trafności klasyfikacji lecz ważniejsza jest dla nich trafność w poszczególnych klasach, w
szczególności osób w gorszym stanie (analiza "confusion matrix" jest bardzo pożadana).
•

Plik z chomika:

Inne pliki z tego folderu:

Inne foldery tego chomika:

Zgłoś jeśli naruszono regulamin